专利名称 | 一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法 | 申请号 | CN201610905670.7 | 专利类型 | 发明专利 | 公开(公告)号 | CN106529204A | 公开(授权)日 | 2017.03.22 | 申请(专利权)人 | 中国科学院计算技术研究所 | 发明(设计)人 | 尹吉澧;孟佳明;刘超;迟浩;陈镇霖;孙瑞祥;董梦秋;贺思敏 | 主分类号 | G06F19/16(2011.01)I | IPC主分类号 | G06F19/16(2011.01)I | 专利有效期 | 一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法 至一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法 | 法律状态 | 实质审查的生效 | 说明书摘要 | 本发明提供一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法,包括:1)分别对每个谱图进行单谱匹配和排序,得到对应的最优的交联二肽单谱匹配结果;提取当前每一个肽谱匹配结果的多谱匹配特征向量,其中包括SVM分数、母离子误差比例特征和修饰比例特征等动态特征;2)在所得到的交联二肽匹配结果中,取FDR在预设的FDR阈值以内的属于正样本的结果构建正样本库,取所有负样本的结果构建反样本库;基于新的训练样本更新各个多谱匹配特征向量;3)训练SVM分类器;4)用本轮训练后的SVM分类器对所有交联二肽结果进行重打分;5)根据预设的迭代条件判断是否继续进行迭代,结束迭代时基于当前SVM分数输出多谱排序结果。本发明的多谱排序方法灵敏度高且性能稳定。 |
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