一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法

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专利名称 一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法 申请号 CN201610905670.7 专利类型 发明专利 公开(公告)号 CN106529204A 公开(授权)日 2017.03.22 申请(专利权)人 中国科学院计算技术研究所 发明(设计)人 尹吉澧;孟佳明;刘超;迟浩;陈镇霖;孙瑞祥;董梦秋;贺思敏 主分类号 G06F19/16(2011.01)I IPC主分类号 G06F19/16(2011.01)I 专利有效期 一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法 至一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法 法律状态 实质审查的生效 说明书摘要 本发明提供一种基于半监督学习的交联质谱多谱排序方法,包括:1)分别对每个谱图进行单谱匹配和排序,得到对应的最优的交联二肽单谱匹配结果;提取当前每一个肽谱匹配结果的多谱匹配特征向量,其中包括SVM分数、母离子误差比例特征和修饰比例特征等动态特征;2)在所得到的交联二肽匹配结果中,取FDR在预设的FDR阈值以内的属于正样本的结果构建正样本库,取所有负样本的结果构建反样本库;基于新的训练样本更新各个多谱匹配特征向量;3)训练SVM分类器;4)用本轮训练后的SVM分类器对所有交联二肽结果进行重打分;5)根据预设的迭代条件判断是否继续进行迭代,结束迭代时基于当前SVM分数输出多谱排序结果。本发明的多谱排序方法灵敏度高且性能稳定。

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