| 专利名称 | 一种肽段液相色谱保留时间预测方法及系统 | 申请号 | CN201610941299.X | 专利类型 | 发明专利 | 公开（公告）号 | CN106248844A | 公开（授权）日 | 2016.12.21 | 申请（专利权）人 | 中国科学院计算技术研究所 | 发明（设计）人 | 涂慧君;刘超;迟浩;贺思敏 | 主分类号 | G01N30/86(2006.01)I | IPC主分类号 | G01N30/86(2006.01)I | 专利有效期 | 一种肽段液相色谱保留时间预测方法及系统 至一种肽段液相色谱保留时间预测方法及系统 | 法律状态 | 实质审查的生效 | 说明书摘要 | 本发明提出一种肽段液相色谱保留时间预测方法及系统，涉及生物信息学，该方法包括对原始质谱数据文件进行搜索，获取肽段?谱图匹配作为鉴定结果，对于所述鉴定结果中FDR小于1％的来自目标库的肽段?谱图匹配，提取肽段?谱图匹配中相应肽段的实验保留时间，并设置训练样本与测试样本；使用所述训练样本，将带有修饰的氨基酸作为新氨基酸，建立多元线性回归模型，使用梯度下降法求解每种氨基酸的保留系数；对所述训练样本中的每条肽段，提取56维特征，并计算相应的特征值；建立预测模型，对所述测试样本中已知序列的肽段进行保留时间预测。本发明可以用于不同色谱条件下带有修饰的肽段的保留时间预测，大大提升了速度，在不同的数据集合上与Elude对比，速度加快了30倍以上。 |
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