基于基因空间融合的矩阵分解对老药预测新适应症的方法

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专利名称 基于基因空间融合的矩阵分解对老药预测新适应症的方法 申请号 CN201410302140.4 专利类型 发明专利 公开(公告)号 CN104021316A 公开(授权)日 2014.09.03 申请(专利权)人 中国科学院自动化研究所 发明(设计)人 刘西;代文;高一波;卢朋 主分类号 G06F19/00(2011.01)I IPC主分类号 G06F19/00(2011.01)I;G06K9/66(2006.01)I 专利有效期 基于基因空间融合的矩阵分解对老药预测新适应症的方法 至基于基因空间融合的矩阵分解对老药预测新适应症的方法 法律状态 实质审查的生效 说明书摘要 本发明公开了一种基于基因空间融合的矩阵分解对老药预测新适应症的方法,该方法包括:收集药物和疾病的关联数据;准备基因空间的数据;从基因空间提取基因紧密度矩阵;根据基因紧密度矩阵构造联合空间;根据联合空间计算药物和疾病的特征空间;用药物和疾病的特征空间初始化矩阵分解模型;准备训练样本;对矩阵分解模型进行训练;对训练样本以外的药物-疾病组合进行关联度预测;将样本准备、模型训练和预测过程重复多次,对所有可能的药物-疾病组合,通过取平均值预测其关联度得分;对关联度预测得分排序,设置得分阈值筛选潜在的药物-疾病关联关系,预测药物新的适应症。本发明的方法能够比较准确的筛选出潜在的药物-疾病关联关系。

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