| 专利名称 | 基于支持向量机的剪接位点识别方法 | 申请号 | CN201210572684.3 | 专利类型 | 发明专利 | 公开（公告）号 | CN103902853A | 公开（授权）日 | 2014.07.02 | 申请（专利权）人 | 中国科学院深圳先进技术研究院 | 发明（设计）人 | 魏丹;姜青山;魏彦杰 | 主分类号 | G06F19/24(2011.01)I | IPC主分类号 | G06F19/24(2011.01)I | 专利有效期 | 基于支持向量机的剪接位点识别方法 至基于支持向量机的剪接位点识别方法 | 法律状态 | 实质审查的生效 | 说明书摘要 | 本发明涉及一种基于支持向量机的剪接位点识别方法，包括：构建数据集，数据集包括训练数据集及测试数据集；提取训练数据集的剪接位点序列的特征向量，记为第一特征向量；提取训练数据集的剪接位点上游序列及下游序列的特征向量，记为第二特征向量；根据第一特征向量及第二特征向量选取所述训练数据集的特征向量，记为第三特征向量；根据第三特征向量，构建SVM分类器；根据分类器识别所述测试数据集的剪接位点。本发明采用训练数据集构建马尔可夫模型，用该模型参数将训练数据集及测试数据集转换成特征向量，并将该特征向量和剪接位点上、下游密码子使用偏性的特征向量，进行线性组合，以提取剪接位点邻近序列中更多信息，从而提高分类精度。 |
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