一种基于HCD与ETD质谱图的肽段从头测序方法及系统

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专利名称 一种基于HCD与ETD质谱图的肽段从头测序方法及系统 申请号 CN201210501813.X 专利类型 发明专利 公开(公告)号 CN103852513A 公开(授权)日 2014.06.11 申请(专利权)人 中国科学院计算技术研究所;北京市生命科学研究所 发明(设计)人 迟浩;陈海丰;孙瑞祥;董梦秋;贺思敏 主分类号 G01N27/62(2006.01)I IPC主分类号 G01N27/62(2006.01)I 专利有效期 一种基于HCD与ETD质谱图的肽段从头测序方法及系统 至一种基于HCD与ETD质谱图的肽段从头测序方法及系统 法律状态 实质审查的生效 说明书摘要 本发明提供一种基于HCD与ETD质谱图的肽段从头测序方法及系统,该方法包括:步骤1,将HCD与ETD的质谱图对应起来形成一个新质谱图,对所述新质谱图进行预处理,检测出有效谱峰并删除干扰谱峰;步骤2,根据所述有效谱峰构建有向无环图;步骤3,在所述有向无环图中寻找符合权重规则的路径,并根据所述路径生成候选肽段;步骤4,将所述候选肽段与所述新质谱图进行匹配打分,按照打分结果将所述候选肽段进行排序并输出。本发明弥补了单种碎裂类型引起的谱峰不全的缺点,结合HCD与ETD谱图各自的优点,提高从头测序的准确度。同时在从头测序之前进行预处理,去除大量同位素谱峰与噪音谱峰,避免其对从头测序算法造成干扰。并利用更加有区分度的打分算法,提高了从头测序的性能。

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