| 专利名称 | 开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统 | 申请号 | CN201210451907.0 | 专利类型 | 发明专利 | 公开(公告)号 | CN103810200A | 公开(授权)日 | 2014.05.21 | 申请(专利权)人 | 中国科学院计算技术研究所 | 发明(设计)人 | 迟浩;孙瑞祥;王乐珩;张文力;贺思敏 | 主分类号 | G06F17/30(2006.01)I | IPC主分类号 | G06F17/30(2006.01)I | 专利有效期 | 开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统 至开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统 | 法律状态 | 实质审查的生效 | 说明书摘要 | 本发明有关于一种开放式蛋白质鉴定的数据库搜索方法及其系统,其中该方法包括:步骤1,输入蛋白质序列,模拟切分每一条蛋白质序列,并将所有生成的子序列按照质量排序,生成肽序列数据表,并根据该肽序列数据表建立索引文件;步骤2,输入质谱图,对每张质谱图,提取谱峰生成查询集合,查询所述索引文件,得到序列集合;步骤3,对每张质谱图及其对应的序列集合,根据修饰组合,生成候选肽段并打分;步骤4,对打分结果进行整合,并进行肽段到蛋白质的推断,得到鉴定结果。本发明允许用户不指定酶切和修饰的类型,或指定其中的任意类型进行蛋白质鉴定,用于解决任意类型的酶切和修饰的鉴定问题。 |
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