专利名称 | 一种使用串联质谱数据鉴定肽的方法 | 申请号 | CN200410088779.3 | 专利类型 | 发明专利 | 公开(公告)号 | CN1769891 | 公开(授权)日 | 2006.05.10 | 申请(专利权)人 | 中国科学院计算技术研究所 | 发明(设计)人 | 高文;付岩;李德泉;孙瑞祥;贺思敏;杨强;曾嵘;周虎;陈益强;王晓彪 | 主分类号 | G01N33/48(2006.01) | IPC主分类号 | G01N33/48(2006.01);G01N30/72(2006.01);G01N23/00(2006.01) | 专利有效期 | 一种使用串联质谱数据鉴定肽的方法 至一种使用串联质谱数据鉴定肽的方法 | 法律状态 | 实质审查的生效 | 说明书摘要 | 本发明公开了一种使用串联质谱数据鉴定肽的 方法,包括步骤:将要被鉴定的肽进行实验碎裂以生成实验串 联质谱;将数据库中的多个候选肽进行理论碎裂以生成多个理 论串联质谱;用径向基函数核分别计算多个理论串联质谱与实 验串联质谱的相似度,该径向基函数包括一指数部分;根据所 计算的相似度选取出与实验串联质谱最相似的理论串联质谱 所对应的肽作为鉴定结果。本发明的使用串联质谱数据鉴定肽 的方法采用径向基函数核来评价多个理论串联质谱与实验串 联质谱的相似度,并进一步在径向基函数核的指数部分通过对 连续碎片离子的求和来强调连续碎片离子的正相关特性,比现 有技术中鉴定肽的方法具有更高的准确率,明显降低了假阳性 结果。 |
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