一种检测核酸降解组的通用探针芯片方法

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专利名称 一种检测核酸降解组的通用探针芯片方法 申请号 CN201210364857.2 专利类型 发明专利 公开(公告)号 CN103074418A 公开(授权)日 2013.05.01 申请(专利权)人 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所 发明(设计)人 李炯;沈叶;郑克孝;赵转 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I IPC主分类号 C12Q1/68(2006.01)I 专利有效期 一种检测核酸降解组的通用探针芯片方法 至一种检测核酸降解组的通用探针芯片方法 法律状态 授权 说明书摘要 一种检测核酸降解组的通用探针方法,包括如下步骤:1)采用生物信息学方法预测可能被小分子RNA降解的目标核酸降解组mRNA;2)设计一端部的部分核酸序列与目标核酸降解组mRNA断裂处的部分核酸序列互补的检测探针;3)将检测探针固定在生物芯片基质上形成生物芯片;4)提取待检测样本RNA,在其5’端接上一段接头,并进行反转录;5)采用与接头序列互补的正向引物以及与反转录产物部分互补的反向引物对反转录产物进行PCR扩增;6)将PCR扩增产物和通用报告探针混入杂交液中与生物芯片杂交;7)洗涤杂交后的生物芯片,检测杂交结果。本发明能够高通量的检测小分子RNA介导的靶基因mRNA降解产物,且操作简便,价格低廉,具有高性价比,利于推广。

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