专利名称 | 基于通路模式挖掘的中药活性成分预测方法 | 申请号 | CN201210309385.0 | 专利类型 | 发明专利 | 公开(公告)号 | CN102841186A | 公开(授权)日 | 2012.12.26 | 申请(专利权)人 | 中国科学院自动化研究所 | 发明(设计)人 | 卢朋;代文;高一波;陈琳;刘西;宋江龙;陈迪;温伟娜 | 主分类号 | G01N33/15(2006.01)I | IPC主分类号 | G01N33/15(2006.01)I | 专利有效期 | 基于通路模式挖掘的中药活性成分预测方法 至基于通路模式挖掘的中药活性成分预测方法 | 法律状态 | 实质审查的生效 | 说明书摘要 | 本发明公开了一种基于通路模式挖掘的中药活性成分预测方法,该方法包括如下步骤:收集中药的含有CAS登记号的化合物成分数据;收集化合物的关联基因,形成化合物-基因关联对,依据关联基因的出现频率对基因进行排序,形成关联基因列表;设置阈值筛选频繁基因,形成生物通路数据集,每一个频繁基因对应一条生物通路数据记录;针对生物通路数据集挖掘通路模式;对频繁基因进行评分;对化合物活性进行评分;对基因得分和化合物活性得分设置阈值,依此对化合物-基因关联对进行筛选,保留剩下的化合物,从而预测中药的活性成分。 |
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